如题。
大家有什么好的建议？

可以考虑类似snapshot文件系统的实现，代价会是比较大的。
大致思想是这样：
整个系统实现snapshot文件系统，对当前文件系统设置一个snap，可以保存所有文件的当前状态，在将来还可以把整个文件系统恢复到这个snap状态。你也可以从某个snap当中复制某个文件到当前状态。
一个snapshot文件系统的性能是比较差的，而且占用空间也相当多，不过你要实现多文件的原子操作，可以考虑类似文件系统级的实现。具体的snapshot文件系统的原理可以在网上搜一下。