刚弄linux几天，我现在建了个工程（就是自己在一个目录下建立了folder1，folder2，include文件夹和main.c，然后在folder1下新建file1.c，在folder2下新建file2.c，在include下新建file1.，file2.h）

在file1.c和file2.c中分别定义函数fun1，fun2，在file1.h和file2.h中是fun1和fun2的声明，

我想在main.c中调用fun1和fun2实现功能

可以用gcc编译时候，总是提示undefined reference to“fun1”和undefined reference to“fun2”

我知道问题很低级，请高手们不要笑话我，并且不吝赐教，感激涕零。
                    

gcc -Iinclude main.c file1.c file2.c

linux下工程文件的编译通常借助于makefile，其中定义目标与源的依赖关系，进而实现自动编译

工程的阅读，我通常用source insight
编译的时候，再上传到linux主机，make

楼主的管理方法没问题，将一些有联系的文件放到一起，将头文件与实现文件分开，我也是这样。
不过我使用makefile来管理的。
编程时要注意头文件路径、全局变量的处理：定义、声明等等。

gcc编译的时候包含绝对路径，要让gcc找得到你函数和文件的位置就可以了。