#include中的module.h默认是在哪个目录下呢？我在/usr/include/linux下并没有找到这个文件。
另外想问一下，不同内核版本的linux头文件是不是一样的。比如：我在2.6.20内核的系统上，用2.6.10的头文件会不会有问题。

你引用的是内核下的头文件.
不在/usr/include下.
在:
/usr/src/kernels/2.6.18-8.el5-x86_64/include/linux/module.h 下面...
中间的版本号是不一样的...你选你的就行了..

gcc是怎么找到头文件的？
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回答了这个问题，LZ就明白了一切了，GCC找头文件有三种策略：
1.会在默认情况下指定到/usr/include文件夹(更深层次的是一个相对路径，GCC可执行程序的路径是/usr/bin，那么它在实际工作时指定头文件头径是一种相对路径方法，换算成绝对路径就是/usr/include)
2.GCC还使用了-I指定路径的方式，这一点大家都知道
3.还可以使用一个参数来指示GCC不搜索系统默认路径，这个参数我忘了，你搜一下就知道了

在编译驱动模块时，由于特殊的需求必须强制GCC不搜索系统默认路径，也就是不搜索/usr/include，要自己用-I参数来指定内核头文件路径，这个时候必须在Makefile中指定两个参数，一个是内核头文件路径，一个是强制GCC不搜索系统默认路径。在编译内核时，必须使用一个参数(强制GCC不搜索系统默认路径)，否则就会引起混乱。

明白了上面的原理，LZ自己应该可以找到答案了吧？？？？

 1   我的 module.h是在 内核编译好了的目录下的，不是在/usr/include/linux下，
2    在2.6.20内核的系统上，用2.6.10的头文件应该会有问题，内核的头文件和 当前系统运行的内核不一致。

这个问题很好，
你需要看看linux kernel的Makefile文件了。在什么地方找头文件，它说了算。：）

你的程序是驱动之类的内核层的吧？
它调用的头文件就应该是内核源码里面的include了。一般的系统都把内核源码放在/usr/src下面，如果是自己编译的内核的话，也可以放在别处的。
至于gcc到哪里去找头文件，就看makefile了，或者直接用gcc命令的话，要加上-I来指定目录。