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ScalaBLAST

    来源:    发布时间:2014-12-19

    本文导语:  ScalaBLAST 是 NCBI BLAST 库的一个高性能的多处理器实现。它支持所有5个主要类型:BLASTN,BLASTP,TBLASTN,tblastx和Blastx和多种输出格式(pairwise, tabular和XML)。 它运行在大多数已安装的MPI的多处理器系统,可以运行在一个互连的种...

ScalaBLAST 是 NCBI BLAST 库的一个高性能的多处理器实现。它支持所有5个主要类型:BLASTN,BLASTP,TBLASTN,tblastx和Blastx和多种输出格式(pairwise, tabular和XML)。

它运行在大多数已安装的MPI的多处理器系统,可以运行在一个互连的种类繁多,包括InfiniBand,二次曲面和以太网。它被设计用来运行大量的查询,对或大或小的数据库。它通过使用故障恢复方案的处理器动态调度跨并行计算的BLAST。


    
 
 

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