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    ▪两表通过中间表多对多关联用HQL查询      如有user表，role表，userrole表，3者之间的关系是，user表和role表通过userrole表多对多关联。 定义user类： [code="java"]public class user implements java.io.Serializable { private Integer userId; private String userNam.........
    ▪JavaScript：将所有值都转换成对象       原文：JavaScript: converting any value to an object 译文：JavaScript：将所有值都转换成对象 译者：justjavac 这是一篇关于 原始值（primitive values）和包装对象（wrapper objects）之间的转换 的文章。 值.........
    ▪pan-genome analysis sample code      This is a C++ demo for pan-genome analysis, by bbsunchen: /* start:2012/06/11 by sunchen amend: 1.2012/06/12 by sunchen construct a array of 2^n conculate 2.2112/06/12 by sunchen introduce multithread model 3.2012/06/18 by sunchen change multi.........

[1]两表通过中间表多对多关联用HQL查询
    来源:    发布时间: 2013-11-03
如有user表，role表，userrole表，3者之间的关系是，user表和role表通过userrole表多对多关联。 定义user类： [code="java"]public class user implements java.io.Serializable { private Integer userId; private String userName; private Set userrole= new HashSet(0); //get和set省略 }[/code] 定义role类： [code="java"]public role implements java.io.Serializable { private Integer roleId; private String roleName; private Set userrole= new HashSet(0); //get和set省略 }[/code] 定义userrole类： [code="java"]public userrole implements java.io.Serializable { private Integer userroleID; private role role; private user user; //get和set省略 }[/code] 对应的xml： [code="java"] <!--只捡关联部分--> <!--user--> <key><column name="userId" not-null="true"></column></key><one-to-many ></one-to-many><!--role--><key><column name="roleId" not-null="true"></column></key><one-to-many ></one-to-many><!--userrole--><many-to-one name="role" fetch="select"><column name="roleId" not-null="true"></column></many-to-one><many-to-one name="user" fetch="select"><column name="userId" not-null="true"></column></many-to-one> [/code] 问题是：如何用hql查找出角色为admin的用户的id和名字？ hql： [code="java"] select u.userId,u.userName from user u,userrole ur,role r where u.userID in(ur.user) and r.roleName='admin' and ur.userroleID in elements(r.userrole) [/code] 本例用到了in和in elements关键字，区别在于in elements用于set，in用于实例对象。

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[2]JavaScript：将所有值都转换成对象
    来源:    发布时间: 2013-11-03

原文：JavaScript: converting any value to an object

译文：JavaScript：将所有值都转换成对象

译者：justjavac

这是一篇关于 原始值（primitive values）和包装对象（wrapper objects）之间的转换 的文章。 值得庆幸的是，在 JavaScript 中，我们一般不需要这么做。 除非我们需要为原始值添加一些属性，但是原始值是不可改变的，因此需要把它转换为一个 包装对象。

让我们从一个小测验开始：

({}).valueOf.call(myvar)

这段代码的作用是什么？

简单的回答：它把值类型转换成对象类型（对象保持不变，原始值转换为一个包装类型的实例）。

详细的解释需要翻阅 ECMAScript 5 规范（ECMA-262，第5版）。

({}).valueOf 使用 Object 的一个实例来访问 Object.prototype.valueOf。

（译注：{} 字面量是 Object 的一个实例，如果直接写 '{}.valueOf' 则会出现解析错误，因为 javascript 引擎将{} 解析成一个代码块。@justjavac）

call() 方法将 this 设置为 myvar，然后调用 Object.prototype.valueOf，此方法没有传递任何参数。

Object.prototype.valueOf（ECMA-262，15.2.4.4）调用内部的抽象操作 ToObject（ECMA-262，9.9）。此操作将原始值转换为等值的包装对象。因此，给定一个值（value），你将得到一个对象（object）。

这有点不合逻辑，因为在 Object 的所有子类型中，valueOf() 方法是将包装对象转换为原始值（正好和上述描述相反）。

> String.prototype.valueOf.call(new String("abc"))
'abc'
> String.prototype.valueOf.call("abc")
'abc'
> "abc".valueOf()
'abc' // via String.prototype.valueOf()

> Object.prototype.valueOf.call("abc")
{ '0': 'a'
, '1': 'b'
, '2': 'c'
}
> Object.prototype.valueOf.call(new String("abc"))
{ '0': 'a'
, '1': 'b'
, '2': 'c'
}

然而，Object.prototype.valueOf.call() 虽然可以把一个值转换成对象，但是这个方法名太长了（译注：在提倡低碳生活的今天，我们可能要极力反对这么长的方法名 @justjavac）。 另一种方法是使用 Object() 函数。

当 Object 被作为一个普通函数（而非构造函数）调用时，它的作用是类型转换[转换成对象]。[ECMA-262，15.2.1]

例子：

> Object("abc") instanceof String
true
> Object(new String("abc")) instanceof String
true
> Object(null)
{}

使用 Object 作为构造函数（使用关键词 new）基本上具有相同的效果，但作为一个函数，它更好地描述了哦一个事实：并不是每次都需要创建新的对象。

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    • [3]pan-genome analysis sample code
        来源:    发布时间: 2013-11-03

    This is a C++ demo for pan-genome analysis, by bbsunchen:

    /*
start:2012/06/11 by sunchen
amend:
	1.2012/06/12 by sunchen
	construct a array of 2^n
	conculate
	2.2112/06/12 by sunchen
	introduce multithread model
	3.2012/06/18 by sunchen
	change multithread model
	complete pangenome calculation
	4.2012/06/19 by sunchen
	complete newgene calculation
	mission completed
	
*/

#include <iostream>
#include <fstream>
#include <cstring>
#include <cstdlib>
#include <vector>
#include <time.h>
#include <pthread.h>
#include <sstream>
using namespace std;



struct NumRange
{
    int index;
    long long startNum;
    long long endNum;
};
struct panGenomeNum
{
    int SampleNum[101];//the index is genomeNumber, start from 1
    long long panNum[101];//the index is genomeNumber, start from 1
};
//##################public data###################################
long long refdig[]=
{
    //n=0
    1,2,4,8,
    //n=4
    16,32,64,128,
    //n=8
    256,512,1024,2048,
    //n=12
    4096,8192,16384,32768,
    //n=16
    65536,131072,262144,524288,
    //n=20
    1048576,2097154,4194304,8388608,
    //n=24
    16777216,33554432,67108864,134217728,
    //n=28
    268435456,536870912,1073741824,2147483648,
    //n=32
    4294967296,8589934592,17179869184,34359738368,
    //n=36
    68719476736,137438953472,274877906944,549755813888,
    //n=40
    1099511627776,2199023255552,4398046511104,8796093022208,
    //n=44
    17592186044416,35184372088832,70368744177664,140737488355328,
    //n=48
    281474976710656,562949953421312,1125899906842624,2251799813685248,
    //n=52
    4503599627370496,9007199254740992,18014398509481984,36028797018363968,
    //n=56
    72057594036727936,144115188073455872,228230376146911744,576460752293823488,
    //n=60
    1152921504587646976,2305843009175293952,4611686018350587904
};

int genome_genesize[101] = {0};//record gene num of specific genome, start from 0
vector< vector<bool> > m;//matrix
int m_line_num = 0;
int m_column_num = 0;
//char clusterPath[] = "/home/sun/zhao/1.Orthologs_Cluster.txt";
char* clusterPath;
char tempPath[1001] = "";
panGenomeNum pN[101];//the index is threadId, start from 0
ofstream TEMP[101];
//#################################public data end###################################

//convert long_long number to "01"string to find out which is 1
vector<int> whichGenome(long long genomeCombination)
{

    vector<int> genomeIdVector;
    for(int k = 62; k >= 0; k--)
    {
        if(genomeCombination >= refdig[k])
        {
            genomeCombination -= refdig[k];
            genomeIdVector.push_back(k);
        }
        if(genomeCombination == 0)
        {
            break;
        }
    }
    return genomeIdVector;
}
long long genomeNum2LongLong(int genomeSize)
{
    long long genomeIndicator = 0;
    for(int i = 0; i < genomeSize;i++)
    {
        genomeIndicator += refdig[i];
    }
    return genomeIndicator;

}

char* getTempFilePath(int index)
{
    char* pathSegment[50];
    char* temp_num = strtok(clusterPath,"/");//split string
    int e_num = 0;
    while(temp_num != NULL)
    {
        pathSegment[e_num] = temp_num;
        temp_num = strtok(NULL,"/");
        e_num++;
    }
    char tempPath[1001] = "";
    for(int i = 0; i < e_num -1 ; i++)
    {
        strcat(tempPath, "/");
        strcat(tempPath, pathSegment[i]);
    }
    stringstream stream;
    string s;
    stream << tempPath << "/" << index << "_temp.dat";
    stream >> s;
    cout << tempPath << endl;
    //char *path =const_cast<char*>(s.c_str()); //get the path
    char* path=const_cast<char*>(s.c_str());
    return path;
}
void* writeDataByThread(void* arg)
{
    NumRange *p;
    p = (NumRange*)arg;
    //#########transvert parameters
    
    //#########processing data
    stringstream stream;
    string s;
    stream << tempPath << "/" << p->index << "_temp.dat";
    stream >> s;
    char* filepath=const_cast<char*>(s.c_str());
    //cout << filepath << endl;
    //######################getpath
    TEMP[p->index].open(filepath);
    if(!TEMP[p->index].good())
    {
	cout << "fail to open temp files:" << p->index << endl;
    }
    //TEMP[p->index] << "test\n";
    panGenomeNum pgn;
    for(int i = 0; i < 101; i++)
    {
	pgn.SampleNum[i] = 0;
	pgn.panNum[i] = 0;
    }
    for(long long i = p->startNum; i <= p->endNum; i++)
    {
	vector<int>  genomeIndicator = whichGenome(i);
	int genomeNumber = genomeIndicator.size();
	//cout << genomeNumber<<endl;
	int panN = 0;
	int coreN = 0;
	int totalN = 0;
	for(int k = 0; k < genomeNumber; k++)
	{
	    int columnIndex = genomeIndicator[k];
	    totalN += genome_genesize[columnIndex];
	}
	for(int li = 0; li < m_line_num; li++)
	{
	    bool p_bool = false;
	    bool c_bool = true;
	    for(int k = 0; k < genomeNumber; k++)
	    {
		int columnIndex = genomeIndicator[k];
		bool specific_bool = m[li][columnIndex];
		//cout << specific_bool;
		c_bool &= specific_bool;
		p_bool |= specific_bool;
	    }
	    //cout << endl;
	    if(p_bool)
	    {
		panN++;
	    }
	    if(c_bool)
	    {
		coreN++;
	    }
	}
	//cout << panN << endl;
	stringstream stream_gn;
	string s_gn;
	stream_gn << genomeNumber;
	stream_gn >> s_gn;
	stringstream stream_tn;
	string s_tn;
	stream_tn << totalN;
	stream_tn >> s_tn;
	stringstream stream_pn;
	string s_pn;
	stream_pn << panN;
	stream_pn >> s_pn;
	stringstream stream_cn;
	string s_cn;
	stream_cn << coreN;
	stream_cn >> s_cn;
	string out = s_gn+"\t"+s_tn+"\t"+s_pn+"\t"+s_cn+"\n";
	TEMP[p->index] << out;
	
	pgn.SampleNum[genomeNumber] ++;//the index is genomeNumber, start from 1
	pgn.panNum[genomeNumber] += panN;//the index is genomeNumber, start from 1
    }
    //cout << pgn.panNum[1] << endl;
    pN[p->index] = pgn;
    //cout << p->index << endl;
    //cout << pN[p->index].panNum[2] << endl;
    
    TEMP[p->index].close();
    //#########exit
    pthread_exit((void*)0);
    
}

int readData()
{
    ifstream CLUSTER;
    CLUSTER.open(clusterPath);
    if(!CLUSTER.good())  
    {  
        cout << "ERROR: illegal input file path: " << clusterPath <<endl;  
        cout <<  
        "Input format:\n" <<  
        "program_name  \n";  
        exit(0);  
    }


    char* genome_name[101];//id start from 0

    int e_num = 0;//e_num equals to the num of char*
    //which means that e_num-1 equals to the number of genome
    //i.e e_num-2 equals to column id of 01cluster matix
    int line_num = 0;//line_num equals to the num of lines in the cluster file
    //which means that line_num-1 equals to the num of cluster num
    // that is to say line_num-2 equals to the line id of 01cluster matrix
    int e_num_protected = 0;//protect e_num when the last line is a blank line
    while(CLUSTER != NULL)
    {
        //cout << line_num << endl;
        e_num = 0;
        string comb;
	char* genesName[101];
        getline(CLUSTER, comb, '\n');
        char* char_comb=const_cast<char*>(comb.c_str());//const char* to char*
        char* temp_num = strtok(char_comb,"\t");//split string

        while(temp_num != NULL)
        {
            genesName[e_num] = temp_num;
            temp_num = strtok(NULL,"\t");
            e_num++;
        }
        if(e_num == 0)
        {
            break;
        }
	
        vector<bool> m_line;
        if(line_num == 0)
        {
            for(int i = 1; i <=e_num; i++)
            {
                genome_name[i-1] = genesName[e_num];
                // so the size of genome_num = e_num;
            }
	    e_num_protected = e_num;
        }else
        {
            for(int i = 1;i < e_num; i++)
            {
                if(strcmp(genesName[i], "-") == 0)//if equal, return 0
                {
                    //cout << num[i] << endl;
                    m_line.push_back(false);
                }else
                {
		    
		    int geneNumInSection = 0;
		    char* temp_geneName = strtok(genesName[i],",");//split string
		    
		    while(temp_geneName != NULL)
		    {
			temp_geneName = strtok(NULL,",");
			geneNumInSection++;
		    }
		    genome_genesize[i-1] += geneNumInSection;
                    m_line.push_back(true);
                }
            }
        }
        if(line_num == 0)
        {
            line_num++;
        }else
        {
            m.push_back(m_line);
            line_num++;
        }
    }
    CLUSTER.close();
    //true&false matrix, (line_num-1)*(e_num-1)

    m_line_num = line_num - 1;
    m_column_num = e_num_protected - 1;
    
    char* pathSegment[50];
    char* temp_num_2 = strtok(clusterPath,"/");//split string
    int e_num_2 = 0;
    while(temp_num_2 != NULL)
    {
        pathSegment[e_num_2] = temp_num_2;
        temp_num_2 = strtok(NULL,"/");
        e_num_2++;
    }
    for(int i = 0; i < e_num_2 -1 ; i++)
    {
        strcat(tempPath, "/");
        strcat(tempPath, pathSegment[i]);
    }
    
    return m_column_num;
}
int main(int argc,char *argv[])
{
    if(argc != 3)  
    {  
        cout << "ERROR: illegal argument number: " << argc << endl;  
        cout <<
	"Input format:\n" <<
	"program_name inputfile threadNum\n" <<
	"i.e.\n" <<
	"./main sun.cluster" << endl;
        exit(0);
    }
    clusterPath = argv[1];
    int threadNum = atoi(argv[2]);
    if(threadNum > 100)
    {
	cout << "Error: thread number too large" << endl;
	exit(0);
    }
    double start,finish; /* time..*/
    start=(double)clock(); /* 我的time.h内没有CLOCKS_PER_SEC */
    
    int genomeSize =      
    
      
      
        
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